Talk:Benefit-risk assessment of Baltic herring and salmon intake: Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
Line 1: | Line 1: | ||
== Needs and updates 8.6.2017 == | == Needs and updates 8.6.2017 == | ||
* Amountissa on 2x liikaa olisiko assumpUnit ongelmana. Siellä kirjoitusvirhe: AssumpUnit -> assumpUnit. | '''[[Goherr: Fish consumption study]] | ||
* Ihd erf muutettava relative hill:ksi. RR ei voi mennä lähelle nollaa. BRA-annosvastetaulukkoon CHD2 mortality ja Relative Hill. | * Amountissa on 2x liikaa olisiko assumpUnit ongelmana. Siellä kirjoitusvirhe: AssumpUnit -> assumpUnit. {{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | ||
'''[[Benefit-risk assessment of Baltic herring and salmon intake]] | |||
* Ihd erf muutettava relative hill:ksi. RR ei voi mennä lähelle nollaa. BRA-annosvastetaulukkoon CHD2 mortality ja Relative Hill. {{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
** Ihd af on järjetön ilmeisesti RR:stä johtuen. Tarkista kun annosvaste on korjattu. | ** Ihd af on järjetön ilmeisesti RR:stä johtuen. Tarkista kun annosvaste on korjattu. | ||
* D vit on mg eikä ug vaikka erf on ug. Korjaa conciin /100 -> *(1000/100){{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
* D vit on mg eikä ug vaikka erf on ug. Korjaa conciin /100 -> *(1000/100) | * Exposure kuva alkakoon 1e-2 koodissa BRA/{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | ||
* Exposure kuva alkakoon 1e-2 koodissa BRA/ | |||
* Tarkasta missä responsien nimiä käytetään ettei tule mismatch. | * Tarkasta missä responsien nimiä käytetään ettei tule mismatch. | ||
* Tee ERFs of interst-taulukkoon uusi sarake | * Tee ERFs of interst-taulukkoon uusi sarake Resp jossa käyttönimet. Laskennassa kuitenkin käytetään Responsea paitsi BoDt ja disabilityweight (taulukko DALYs of responses), joissa muunnettava nimet joka tapauksessa.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | ||
* Muuta tooth defect käyttämään ensimmäistä vastetta.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
* Onko tooth defect todennäköisyys, oletusarvo vai vasteen vakavuus? Pitää olla täsmällinen. | * Onko tooth defect todennäköisyys, oletusarvo vai vasteen vakavuus? Pitää olla täsmällinen. | ||
** Tooth defectejä luokkaa 100000. Mistä näin paljon? | ** Tooth defectejä luokkaa 100000. Mistä näin paljon? | ||
** Tooth defect sisältää infiä ja na ta | ** Tooth defect sisältää infiä ja na ta | ||
* Breast feeding ei näy dose-kuvassa. Pitää piirtää eri kuvaan ja selittää Exposure kummankin kuvan otsikossa. | * Breast feeding ei näy dose-kuvassa. Pitää piirtää eri kuvaan ja selittää Exposure kummankin kuvan otsikossa.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | ||
* Casesabs kuva katsoo vain itereitä eli yhtä maa/sukupuoli/ikäryhmää yhtenä yksikkönä. Niinpä määrätkin ovat vain tälle alaryhmälle ja summautuvat maksimissaan kahteen miljoonaan. Eivät siksi ole mielekkäitä ellei eritellä tarkasti mitä ryhmää katsotaan. | * Casesabs kuva katsoo vain itereitä eli yhtä maa/sukupuoli/ikäryhmää yhtenä yksikkönä. Niinpä määrätkin ovat vain tälle alaryhmälle ja summautuvat maksimissaan kahteen miljoonaan. Eivät siksi ole mielekkäitä ellei eritellä tarkasti mitä ryhmää katsotaan. | ||
* Miksi D-vitamiinisuositus on nolla kaikilla joilla ei ole backgroundia? Senhän pitäisi tuottaa 1 jos alittaa suosituksen ja ilman backgroundia näin käy monelle. | * Miksi D-vitamiinisuositus on nolla kaikilla joilla ei ole backgroundia? Senhän pitäisi tuottaa 1 jos alittaa suosituksen ja ilman backgroundia näin käy monelle. | ||
* Miten change in child iq voi koskettaa niin monia? Sitä ei ole rajoitettu lapsiin. Vaikutustahan ei pitäisi tulla niissä iteraatioissa joissa ei ole nuori nainen. | * Miten change in child iq voi koskettaa niin monia? Sitä ei ole rajoitettu lapsiin. Vaikutustahan ei pitäisi tulla niissä iteraatioissa joissa ei ole nuori nainen. Tämä vaatii useampaa korjaamista: | ||
** exposuressa tehdään sarakkeeseen Exposure "To child" dx.expo.childin riveille ja NA expoRaw:n riveille.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
** frexposed luotaessa säilytetään Iter, jotta rivit säilyvät vaikka non-marginaalit häviäisivät. Tällöin esim. dosea ja amountia ei tarvitse välillä kertoa infolla. Exposure-sarakkeessa ehtona "To child".{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
** ERF:ssä pitää ne Exposuret jotka liittyvät lapseen korvataan "To child" mutta muita ei tarvitse muuttaa. Sama thresholdissa.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
'''[[Exposure-response function]] | |||
** Exposure_unit ei ole marginaali, joten muutetaan määrittelyä. {{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
'''[[Health impact assessment]] and [[Burden of disease]] | |||
* AF laskenta on väärin jos rr<1. Korjaa koodi olioihin BoDpaf ja casesrr. | |||
'''[[ERF of omega-3 fatty acids]] and [[ERF of methylmercury]] | |||
* Childs iq. Mitä tämä tarkasti tarkoittaa? Äo pistettä vai tapausta? Pistettä kai. | |||
** Erf pitäisikö olla + aina haittaa ja - aina hyötyä? Eli äo muutos onkin menetys. Korjaa termi ja etumerkki.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
'''[[ERF of dioxin]] | |||
* TEQ ERF rivit 1 ja 2 ovat oikeasti samassa yksikössä mutta taulukossa lukee eri. Käytä mieluummin jälkimmäistä.{{defend|# |ok|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
'''[[Disease risk]] | |||
* BoDt-ovariablen Response muutetaan Resp:ksi ja vastaamaan BRA:n lokaatioita.{{defend|# |OK|--[[User:Jouni|Jouni]] ([[User talk:Jouni|talk]]) 13:02, 8 June 2017 (UTC)}} | |||
Vanhempia havaintoja ongelmista (tarkista että kaikki kunnossa nyt): | Vanhempia havaintoja ongelmista (tarkista että kaikki kunnossa nyt): |
Revision as of 13:02, 8 June 2017
Needs and updates 8.6.2017
Goherr: Fish consumption study
- Amountissa on 2x liikaa olisiko assumpUnit ongelmana. Siellä kirjoitusvirhe: AssumpUnit -> assumpUnit. ←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
Benefit-risk assessment of Baltic herring and salmon intake
- Ihd erf muutettava relative hill:ksi. RR ei voi mennä lähelle nollaa. BRA-annosvastetaulukkoon CHD2 mortality ja Relative Hill. ←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Ihd af on järjetön ilmeisesti RR:stä johtuen. Tarkista kun annosvaste on korjattu.
- D vit on mg eikä ug vaikka erf on ug. Korjaa conciin /100 -> *(1000/100)←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Exposure kuva alkakoon 1e-2 koodissa BRA/←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Tarkasta missä responsien nimiä käytetään ettei tule mismatch.
- Tee ERFs of interst-taulukkoon uusi sarake Resp jossa käyttönimet. Laskennassa kuitenkin käytetään Responsea paitsi BoDt ja disabilityweight (taulukko DALYs of responses), joissa muunnettava nimet joka tapauksessa.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Muuta tooth defect käyttämään ensimmäistä vastetta.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Onko tooth defect todennäköisyys, oletusarvo vai vasteen vakavuus? Pitää olla täsmällinen.
- Tooth defectejä luokkaa 100000. Mistä näin paljon?
- Tooth defect sisältää infiä ja na ta
- Breast feeding ei näy dose-kuvassa. Pitää piirtää eri kuvaan ja selittää Exposure kummankin kuvan otsikossa.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- Casesabs kuva katsoo vain itereitä eli yhtä maa/sukupuoli/ikäryhmää yhtenä yksikkönä. Niinpä määrätkin ovat vain tälle alaryhmälle ja summautuvat maksimissaan kahteen miljoonaan. Eivät siksi ole mielekkäitä ellei eritellä tarkasti mitä ryhmää katsotaan.
- Miksi D-vitamiinisuositus on nolla kaikilla joilla ei ole backgroundia? Senhän pitäisi tuottaa 1 jos alittaa suosituksen ja ilman backgroundia näin käy monelle.
- Miten change in child iq voi koskettaa niin monia? Sitä ei ole rajoitettu lapsiin. Vaikutustahan ei pitäisi tulla niissä iteraatioissa joissa ei ole nuori nainen. Tämä vaatii useampaa korjaamista:
- exposuressa tehdään sarakkeeseen Exposure "To child" dx.expo.childin riveille ja NA expoRaw:n riveille.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- frexposed luotaessa säilytetään Iter, jotta rivit säilyvät vaikka non-marginaalit häviäisivät. Tällöin esim. dosea ja amountia ei tarvitse välillä kertoa infolla. Exposure-sarakkeessa ehtona "To child".←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- ERF:ssä pitää ne Exposuret jotka liittyvät lapseen korvataan "To child" mutta muita ei tarvitse muuttaa. Sama thresholdissa.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
Health impact assessment and Burden of disease
- AF laskenta on väärin jos rr<1. Korjaa koodi olioihin BoDpaf ja casesrr.
ERF of omega-3 fatty acids and ERF of methylmercury
- Childs iq. Mitä tämä tarkasti tarkoittaa? Äo pistettä vai tapausta? Pistettä kai.
- TEQ ERF rivit 1 ja 2 ovat oikeasti samassa yksikössä mutta taulukossa lukee eri. Käytä mieluummin jälkimmäistä.←--#: . ok --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
- BoDt-ovariablen Response muutetaan Resp:ksi ja vastaamaan BRA:n lokaatioita.←--#: . OK --Jouni (talk) 13:02, 8 June 2017 (UTC) (type: truth; paradigms: science: defence)
Vanhempia havaintoja ongelmista (tarkista että kaikki kunnossa nyt):
- Frexposed country puuttuu ok
- A c g puuttuvat dosesta mutta ei dose2. Ok
- Casesrr on c muttei muita ja sekin marginal.
- Casesabs cag on mutta c marginal
- Bodpaf c on marginal ok
- Bidcsse c on marginal. Samoin bod ok
- Bodcase abs on nelinkertainen rr on vajausta. Ok
- Bodt iteroituu 1000. Pitää muuttaa openv N. Ok
- Funktio joka käy läpi dependencyt ja kirjaa uudet ja tiopuvat indeksit sekä tippuvat lokaatiot. Sources ja prevresults true näyttää myös ne mutta oletuksena on false. OK
- Onko tärkeää näyttää se mistä ovariablesta indeksit tulivaat? Ei kai jos jokaisesta näytetään mitä on. Paramsetrit drops ja news ja currenta näyttävä tippuvat uudet ja nykyiset indeksit. Oletuksena true. OK
- Currentcols sarakkeeseen lokaatiot jos ne ovat muuttuneet mutta muuten ei vaan tieto löytyy loctablesista.
- RR$Age täytyy tarkistaa. Voiko sen poistaa rr n sisällä? Tai voiko sen olla tekemättä ja toteuttaa fiksummin? Ok